Animasyon filmi Müzede Bir Gece: Kahmunrah’ın Yükselişi izle de; Eski Mısır hükümetinin kötü bir lideri olan Kahmunrah (Hank Azaria), eski bir tabletin yardımıyla tekrar hayata dönüşür. Kahmunrah, güçlü bir şekilde yeniden canlanır ve dünya hakimiyeti hedefler. Bu sırada, Kahmunrah'ı durdurmak ve dünyayı kurtarmak için eski müze gece bekçisi Larry Daley (Ben Stiller) ve tarihi figürler, dünyayı kurtarmak için bir araya gelirler.